การแต่งกายด้วยชุดลายพรางทหารของกลุ่มผู้ก่อความไม่สงบ ซึ่งถูกทหารกองร้อยปืนเล็กที่ 2 ชุดเฉพาะกิจนราธิวาส 32 ยิงเสียชีวิตจำนวน 16 คน แสดงว่ากลุ่มผู้ก่อความไม่สงบได้วางแผน เพื่อสร้างความสับสนให้กับเจ้าหน้าที่ แต่แผนเกิดรั่วไหล จึงถูกตอบโต้กลับ
การโจมตีฐานปฎิบัติกองร้อยปืนเล็กที่ 2 เริ่มขึ้นเมื่อเวลาประมาณ01.00 น. เมื่อกลุ่มผู้ก่อความไม่สงบ 30 คน ใช้รถยนต์อย่างน้อย 2 คัน มาจอดหน้าฐานปฎิบัติการ
จากนั้นนายมะรอโซ จันทราวดี แกนนำกองกำลัง RKK ได้นำกำลังทั้งหมดบุกเข้าโจมตีฐานทหารในทันที ทำให้เจ้าหน้าที่จึงเปิดฉากยิงตอบโต้ พร้อมจุดชนวนระเบิดเคโม ซึ่งเป็นระเบิดบังคับทิศทาง ที่มีรัศมีหวังผล กว่า 200 เมตร ซึ่งฝังไว้ด้านหน้าฐานปฎิบัติการอย่างน้อย 5 ลูก จนสร้างความสูญเสียให้กับผู้ก่อความไม่สงบอย่างหนัก กระทั่งล่าถอยไป
หลังการปะทะ แม่ทัพภาคที่ 4 ใช้อำนาจตามกฎอัยการศึกควบคุมสถานการณ์พื้นที่ 4 ตำบล ของอำเภอบาเจาะ และ 2 ตำบล ใน อ.ไม้แก่น จ.ปัตตานี เพื่อติดตามแนวร่วมกลุ่มหนึ่งที่ยังหลบหนี
การเสียชีวิตของครูชลธี เจริญชล ครูโรงเรียนบ้านตันหยง ต.บาเร๊ะใต้ อ.บาเจาะ โดยฝีมือแนวร่วมกลุ่มเดียวกับที่โจมตีฐานทหารถูกวิเคราะห์ว่าเป็นหนึ่งในปัจจัยที่ทำให้กลุ่มแนวร่วมสูญเสียมวลชน จนนำไปสู่การรั่วไหลของแผนการที่จะโจมตีฐานทหาร
การยิงต่อสู้ ระหว่างทหารกับกลุ่มผู้ก่อความไม่สงบ ส่งผลให้บ้านเรือนของครอบครัวสะแม ซึ่งตั้งอยู่หน้าฐานปฎิบัติกองร้อยปืนเล็กที่ 2 ได้รับความเสียหายจากกระสุนปืนในหลายจุด เป็นผลกระทบจากการใช้ความรุนแรงเข้าหากันที่เกิดขึ้นกับประชาชน
นางอังคณา นีละไพจิตร ประธานมูลนิธิยุติธรรมเพื่อสันติภาพ ประธานมูลนิธิยุติธรรมเพื่อสันติภาพ เปิดเผยว่า ฝ่ายความมั่นคง อาจชนะทางยุทธวิธีแบบชั่วคราว แต่อาจพ่ายแพ้ในทางยุทธศาสตร์ระยะยาว เพราะกลุ่มผู้สูญเสียกลับได้รับการยอมรับจากประชาชนในพื้นที่ส่วนหนึ่ง ด้วยมุมมองที่แตกต่าง เป็นจุดอ่อนของสังคมไทยต่อการแก้ปัญหาความไม่สงบ
ด้านนายซากี พิทักษ์คุมพล นักวิชาการสันติวิธี ม.สงขลานครินทร์ นักสันติวิธีมหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ กล่าวว่า หนทางที่จะนำไปสู่สันติสุข สังคมไทยต้องเรียนรู้ที่จะยอมรับความแตกต่างในอัตลักษณ์ของประชาชนในจังหวัดชายแดนภาคใต้ และกลุ่มคนที่จับอาวุธขึ้นมาต่อสู้กับอำนาจรัฐ ไม่ใช่อาชญากรรม แต่เป็นการต่อสู้ทางการเมือง ดังนั้นจึงควรหาทางออกด้วยวิถีทางการเมือง