ศูนย์วิจัยอุบัติเหตุแห่งประเทศไทย พบว่า โครงสร้างของรถตู้โดยสารแทบทุกจุดเป็นอันตรายกับผู้โดยสารหากเกิดเหตุ
1.ประตูขึ้น-ลงมีทางเดียว หากรถพลิกคว่ำหรือตะแคงซ้าย ประตูก็จะเปิดไม่ได้
2.ที่นั่งคนขับและผู้โดยสารด้านหน้า แคบและมีระยะชิดกันมาก จะเป็นอันตรายหากรถชนท้ายรถคันอื่น
3.ที่นั่งผู้โดยสารด้านหลังมี 4 แถว แถวสุดท้ายในสุด มี 4 ที่นั่ง ขึ้น-ลง ลำบาก
4.พื้นที่ภายในตัวรถคับแคบ มีอยู่อย่างจำกัด หากเกิดการชนด้านข้าง คนที่นั่งที่นั่งริม มีโอกาสได้รับอันตรายสูง
5.รถส่วนใหญ่จะติดตั้งถังแก๊สเชื้อเพลิงไว้ใต้เบาะแถวหลังสุด ถังพวกนี้มีน้ำหนักมาก ซึ่งจะส่งผลต่อสมดุลของตัวรถ
6.หน้าต่างขนาดเล็ก หากตัวรถ หรือห้องโดยสารเกิดปัญหา ได้รับความกระทบกระเทือน ช่องหน้าต่างอาจจะเล็กลง ทำให้ออกได้ยาก โดยเฉพาะคนที่ตัวใหญ่
7.ประตูท้าย เบาะหลังมี 4 ที่นั่ง สูงกว่าแถวอื่น ประตูหลังจะใช้ไม่ได้
อย่างไรก็ตาม สิ่งที่รถตู้โดยสารทุกคันควรมีเพื่อความปลอดภัย คือ เข็มขัดนิรภัยค้อนทุบกระจก ถังดับเพลิง จีพีเอส เพื่อควบคุมความเร็ว หรือแม้กระทั่งทางออกฉุกเฉินและคู่มือความปลอดภัย